Иосиф родился в Николаеве в 1792 году. Получив хорошее образование, он поступил в лейб-гвардии Преображенский полк.

В 1818 году в чине штабс-капитана он вышел в отставку и вместе с женой и двумя детьми уехал в имение матери Яновку Киевской губернии, чтобы поправить запущенные дела.

Жена Поджио в 1820 году умерла, оставив ему четверых детей. В 1823 году из гвардии перевелся в Днепровский полк, стоявший по соседству с Яновкой, младший брат Иосифа - Александр, который вскоре тоже вышел в отставку и поселился вместе с ним.

Через брата, члена Южного общества, Иосиф Поджио познакомился с Давыдовым, и тот в 1824 году принял его в тайное общество.

В Каменке Иосиф встречался со многими деятелями Южного общества. Здесь же он познакомился с племянницей Давыдова, Марией Андреевной Бороздиной. В 1825 году они поженились.

6 января 1826 года внезапно был арестован Александр Поджио, а 14 января фельдъегерь увез в Петербург и Иосифа.

Казалось, налицо были основания к оправданию, но нет - он был приговорен к двенадцати годам каторжных работ (впоследствии срок снижен до восьми лет), с лишением чинов, дворянства, и поселению в Сибирь.

10 июля 1834 года по приказу военного министра ворота Шлиссельбургской крепости для Иосифа Поджио открылись, и он с фельдъегерем был направлен на поселение в Восточную Сибирь. Местом ссылки Иосифа Поджио было назначено село Усть-Кудинское.

6 января 1848 года в Иркутске, в доме Волконских, Иосиф Поджио скончался.